Se presentaron los nuevos grupos para la nueva Copa MX correspondiente al Apertura 2013.
En esta nueva edición destaca que Chivas, Tigres, Monterrey y Santos jugarán la Copa tras no participar el año anterior y también estarán ausentes el América, Cruz Azul, Toluca y Xolos para disputar la Concachampions. Para este nuevo torneo que empezará el 23 de julio y terminará el 7 de noviembre, los grupos se conformaron de la siguiente manera:
| Grupo 1 |
| Monterrey |
| Puebla |
| Correcaminos |
| Altamira |
| Grupo 2 |
| Tigres |
| Santos |
| Zacatepec |
| Cruz Azul Hgo. |
| Grupo 3 |
| Atlante |
| Chiapas |
| Mérida |
| Delfines |
| Grupo 4 |
| Veracruz |
| Pachuca |
| Oaxaca |
| Lobos BUAP |
| Grupo 5 |
| Querétaro |
| Pumas |
| Leones Negros |
| San Luis |
| Grupo 6 |
| Chivas |
| León |
| Necaxa |
| Dorados |
| Grupo 7 |
| Atlas |
| Morelia |
| Celaya |
| Estudiantes |